學術生涯，美國時期

憑在美國陸軍參謀大學所修的學分獲密西根大學的取錄，攻讀新聞系，1954年獲學士，1957年獲碩士。由於言語上的局限，黃仁宇其後轉攻歷史系，並於1964年獲博士學位（博士論文：《明代的漕運》)，成為學者余英時於密歇根所指導的唯一博士生。曾先後在南伊利諾大學和紐約州立大學任教，曾任哥倫比亞大學訪問副教授（1967年）及哈佛大學東亞研究所研究員（即現費正清研究所）（1970年）。他曾參與《明代名人傳》、《劍橋中國史》時英國劍橋大學凱思學院院長李約瑟博士主持的《中國的科學與文明》的集體研究工作。

1979年他離開教學崗位，專心寫作，先後出版了《萬曆十五年》、《中國大歷史》，以「大歷史觀」享譽華人學界。因之他後來經常到台灣的大學演講作學術交流，並曾在《亞洲週刊》撰寫專欄。

2000年1月8日因心臟病發，在一場音樂會開場掌聲中，沉睡在夫人懷裡，一睡不起，逝世於紐約。

他的著作近年來在海峽兩岸頗受歡迎，但也有許多學者質疑與批判其觀點。

婚姻家庭

黃仁宇娶美國女子格爾為妻，並育有一子(傑夫)。

學術建樹,大歷史觀

黃仁宇主張「歷史上長期合理性（long-term rationality of history）」、「數字上管理（mathematically manageable）」等概念，是技術至上的論調，透過實證主義，以技術角度談論歷史，避免讓歷史淪於意識形態爭執。這種觀念即為大歷史觀（macro-history）。大歷史觀對於英美微觀剖析歷史方法的一種反動。強調不通過對歷史人物短暫生涯的探究和歷史事件的孤立的分析來研究歷史，而是要通過對當時歷史社會的整體面貌分析和把握進行歷史研究，掌握歷史性社會的結構性特點。例如在《萬曆十五年》中，不探究歷史人物的善惡忠奸（黃仁宇主張歷史從不應該是批判善惡的歷史），他與李約瑟稱這主張為技術辯證，而是把他們放到整個明代的社會框架中進行研究，強調歷史人物、歷史事件之後的邏輯關係和政治文化構架。

「大歷史」（macrohistory）的理論表明，時代走向這種現狀，是由無數社會、物質上各條件所堆積起來的，歷史舞台上那個「關鍵角色」往往只是個角色，讓任何人來扮演都可以，我們熟知的人物只是正好在那個時間踏上了舞台，坐上了歷史早準備好的空缺。這在其作《中國大歷史》一書中表現無遺，謂中國版圖架構的形成，「當中無可避免有其地理歷史因素在，有二千哩容易被人侵犯的地方，中國不得不構成一體...」

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